RAD51-AS1 (RAD51 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RAD51-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
15q15.1
gene_family:
alias symbol:
TODRA
alias name:
transcribed in the opposite dire...
entrez id:
100505648
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ENSG00000245849
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None
refseq accession:
NR_040058
hgnc_id:
HGNC:48621
approved reserved:
2013-05-24

基因染色体位置

基因染色体位置

15q15.1

基因简述

基因简述

RAD51-AS1是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类17号染色体上，与RAD51基因相邻并反向转录。它属于RAD51基因家族，该家族主要参与DNA损伤修复和同源重组修复（HR）过程，对维持基因组稳定性至关重要。RAD51-AS1通过调控RAD51的表达影响DNA修复功能，研究表明它可能通过顺式或反式作用机制抑制RAD51 mRNA的稳定性或翻译效率，从而在DNA损伤反应中起负调控作用。当RAD51-AS1表达降低时，RAD51蛋白水平上升，增强细胞对DNA损伤的修复能力；反之，其过表达会抑制RAD51，可能导致修复缺陷和基因组不稳定性增加。这种调控异常与多种癌症相关，例如乳腺癌、卵巢癌和肺癌中常见RAD51-AS1表达失调。在乳腺癌中，RAD51-AS1低表达可能促进肿瘤细胞对放疗或化疗的耐药性，而过表达则可能抑制肿瘤生长但增加基因组突变风险。此外，该基因的突变或表观遗传沉默可能破坏其与RAD51的平衡，进而影响细胞周期检查点激活和凋亡过程。RAD51基因家族成员（如RAD51B、RAD51C等）均编码保守的RecA样重组酶，在HR中形成核蛋白纤维介导链交换。RAD51-AS1作为家族关联的lncRNA，扩展了该家族在转录后调控层面的功能多样性。其表达受表观遗传修饰（如启动子甲基化）和转录因子（如p53）调控，在发育和应激响应中具有动态变化。研究还提示RAD51-AS1可能通过ceRNA机制竞争性结合miRNA来间接影响其他靶基因网络。总体而言，RAD51-AS1是DNA修复通路的关键调节因子，其表达水平变化可能成为癌症治疗响应的预测标志或干预靶点。

中文English

无

OMIM数据库中对RAD51-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对RAD51-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

RAD51-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RAD51-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1801320       rs1801321       rs2619679       rs2619680       rs2619681       rs3092981       rs5030789       rs5030790       rs5030791       rs7171780       rs28373018       rs28439060       rs34445444       rs34504099       rs35104813       rs35302835       rs35722406      

基因表达

基因表达

RAD51-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGTTTACAGACTGCCCTC
58
CATTACCTCTTGGGAGTCGT
59
GAGTTTACAGACTGCCCTC
58
CATTACCTCTTGGGAGTCGT
59
GGCAGTATCTGAATGTCAGC
59
CTAGTCTGGCAAACTTGCTC
59
CGAGTTTACAGACTGCCCT
59
ATTACCTCTTGGGAGTCGTG
59
GCAGTATCTGAATGTCAGCT
58
CTAGTCTGGCAAACTTGCT
58
CGAGTTTACAGACTGCCCT
59
ATTACCTCTTGGGAGTCGTG
59
CGAGTTTACAGACTGCCCT
59
ATTACCTCTTGGGAGTCGT
58
CGAGTTTACAGACTGCCCT
59
ATTACCTCTTGGGAGTCGT
58
GCAGTATCTGAATGTCAGCT
58
TAGTCTGGCAAACTTGCTC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RAD51-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RAD51-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RAD51-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

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